Determining the substrate specificity of two lysostaphin enzyme family members using NMR spectroscopy
Tekijät
Päivämäärä
2020Pääsyrajoitukset
Tekijä ei ole antanut lupaa avoimeen julkaisuun, joten aineisto on luettavissa vain Jyväskylän yliopiston kirjaston arkistotyösemalta. Ks. https://kirjasto.jyu.fi/fi/tyoskentelytilat/laitteet-ja-tilat..
Tekijänoikeudet
Julkaisu on tekijänoikeussäännösten alainen. Teosta voi lukea ja tulostaa henkilökohtaista käyttöä varten. Käyttö kaupallisiin tarkoituksiin on kielletty.
Yksi merkittävimmistä ihmisen patogeeneista on Staphylococcus aureus-bakteeri. Se aiheuttaa erityyppisiä vakavia infektioita kuten verenmyrkytystä ja sydämen sisäkalvon tulehdusta, sekä lievempiä ihotulehduksia ja ruokamyrkytystä. Tällä hetkellä S. aureus-infektioita hoidetaan beetalaktaami-antibiooteilla (esim. penisilliinillä), mutta antibioottiresistenttien bakteerikantojen kuten MRSA:n yleistymisen vuoksi, on S. aureus-infektioiden hoito erittäin hankalaa. Siksi tarve uudentyyppisille stafylokokki-infektioita hoitaville lääkeaineille onkin kova. Bakteerien soluseinämää pilkkovat entsyymit – peptidoglykaanihydrolaasit – ovat eräs lupaavimmista uudentyyppisistä antistafylokokkaalisista lääkeaineista. Kuten muillakin gram-positiivisilla bakteereilla, S. aureuksella on paksu bakteerisolua suojaava peptidoglykaani-seinämä. Peptidoglykaanihydrolaasit ovat entsyymejä, jotka pilkkovat tiettyjä kemiallisia sidoksia tässä soluseinämässä, aiheuttaen siten bakteerisolun tuhoutumisen. Peptidoglykaanihydrolaasien keskeisimmät hyödyt ovat niiden (1) spesifisyys, sillä entsyymit toimivat kohdennetusti pilkkoen juuri tiettyjä kemiallisia rakenteita bakteerin peptidoglykaani-soluseinämässä, (2) matala myrkyllisyys, (3) entsyymien suhteellisen helppo ja tehokas tuotto, (4) niiden kyky tuhota sekä aktiivisia että inaktiivisia bakteerisoluja ja toimia myös biofilmeissä, sekä lopuksi (5) entsyymien käyttö antibioottien kanssa yhdistelmähoitona. Tässä tutkielmassa tarkastellaan erilaisten synteettisten peptidoglykaanifragmenttien pilkkoutumista kahden peptidoglykaani hydrolaasin toimesta. Tutkittavat entsyymit kuuluvat lysostafiini-entsyymiperheeseen. Entsyymien tehokkuutta erilaisten peptidoglykaanifragmenttien katalyysissä tutkittiin käyttäen liuostilan 1D 1H ydinmagneettista resonanssispektroskopiaa (NMR), joka mahdollistaa hydrolyysireaktioiden reaaliaikaisen seurannan atomiresoluution tasolla. Reaktiotuotteiden rakenteet määritettiin 2D NMR -spektroskopialla. Kummallekin tutkittavista entsyymeistä löydettiin uusia substraatteja eli bakteerien peptidoglykaanirakenteita, joita ne pilkkovat kohdennetusti. Lisäksi peptidoglykaanin entsymaattisesta pilkkoutumisreaktiosta saatiin tarkempaa tietoa, joka mahdollistaa entsyymien modifikaation tulevaisuudessa, ja siten antistafylokokkaalisten lääkeaineiden kehityksen.
...
Asiasanat
Metadata
Näytä kaikki kuvailutiedotKokoelmat
- Pro gradu -tutkielmat [28143]
Samankaltainen aineisto
Näytetään aineistoja, joilla on samankaltainen nimeke tai asiasanat.
-
Chemical shift assignments of the catalytic domain of Staphylococcus aureus LytM
Tossavainen, Helena; Pitkänen, Ilona; Antenucci, Lina; Thapa, Chandan; Permi, Perttu (Springer, 2023)S. aureus resistance to antibiotics has increased rapidly. MRSA strains can simultaneously be resistant to many different classes of antibiotics, including the so-called “last-resort” drugs. Resistance complicates treatment, ... -
Biophysical characterization and interaction study of Staphylococcus aureus LytM
Pitkänen, Ilona (2021)Yleistyvä antibioottiresistenssi on yksi tämän hetken suurimmista terveydenhuollon tulevaisuutta uhkaavista haasteista. Erityisen huolestuttava ilmiö on moniresistenttien bakteerikantojen, kuten metisilliinille resistentin ... -
1H, 13C, and 15N NMR chemical shift assignment of LytM N-terminal domain (residues 26–184)
Pitkänen, Ilona; Tossavainen, Helena; Permi, Perttu (Springer, 2023)Antibiotic resistance is a growing problem and a global threat for modern healthcare. New approaches complementing the traditional antibiotic drugs are urgently needed to secure the ability to treat bacterial infections ... -
Structural and Functional Insights into Lysostaphin-Substrate Interaction
Tossavainen, Helena; Raulinaitis, Vytas; Kauppinen, Linda; Pentikäinen, Ulla; Maaheimo, Hannu; Permi, Perttu (Frontiers Research Foundation, 2018)Lysostaphin from Staphylococcus simulans and its family enzymes rapidly acquire prominence as the next generation agents in treatment of S. aureus infections. The specificity of lysostaphin is promoted by its C-terminal ... -
Fight evolution with evolution: plasmid-dependent phages with a wide host range prevent the spread of antibiotic resistances
Ojala, Ville; Laitalainen, Jarkko; Jalasvuori, Matti (Wiley-Blackwell, 2013)The emergence of pathogenic bacteria resistant to multiple antibiotics is a serious worldwide public health concern. Whenever antibiotics are applied, the genes encoding for antibiotic resistance are selected for within ...
Ellei toisin mainittu, julkisesti saatavilla olevia JYX-metatietoja (poislukien tiivistelmät) saa vapaasti uudelleenkäyttää CC0-lisenssillä.