Construction of a computational data analysis pipeline using a workflow system
Aho, Kaisa-Leena; Kerkelä, Erja; Yli-Harja, Olli; Roos, Christophe (2010)
Aho, Kaisa-Leena
Kerkelä, Erja
Yli-Harja, Olli
Roos, Christophe
Teoksen toimittaja(t)
Nykter, Matti
Ruusuvuori, Pekka
Carlberg, Carsten
Yli-Harja, Olli
2010
Julkaisun pysyvä osoite on
https://urn.fi/URN:NBN:fi:tty-201308131280
https://urn.fi/URN:NBN:fi:tty-201308131280
Kuvaus
Peer reviewed
Tiivistelmä
We present how we used a workflow system to create a computational pipeline for storing, preprocessing and statistically analyzing gene expression microarray data together with public annotation information. The pipeline demonstrates that the used workflow system can facilitate reuse and documentation of the analysis methods which are adaptable to changing integrative data analysis approaches.
Kokoelmat
- TUNICRIS-julkaisut [16740]