Mikroskooppidatan visualisointi VR-teknologialla molekyylilääketieteessä
Mustonen, Kati; Reipas, Sara (2021)
Mustonen, Kati
Reipas, Sara
2021
All rights reserved. This publication is copyrighted. You may download, display and print it for Your own personal use. Commercial use is prohibited.
Julkaisun pysyvä osoite on
https://urn.fi/URN:NBN:fi:amk-202104094475
https://urn.fi/URN:NBN:fi:amk-202104094475
Tiivistelmä
Opinnäytetyön tavoitteena oli luoda työnkulku mikroskooppikuvan viemisestä VR-ympäristöön ja tehdä prototyyppi mikroskooppidatan visualisointimallista VR-ympäristöön. Tarkoituksena oli selvittää, mitä 2D-kuvan muuttaminen VR-muotoon vaatii sekä miten VR-visualisointimallia voidaan hyödyntää Covid-19-vasta-ainetutkimuksen mikroskooppikuvadatan tarkastelussa. Lisäksi tarkoituksena oli selvittää, miten Suomen molekyylilääketieteen instituutin (FIMM) tutkijat kokevat virtuaalitodellisuuden osana tutkimustulosten tarkastelua.
Opinnäytetyön tutkimusmenetelmäksi valittiin konstruktiivinen tutkimusote, koska tarkoituksena oli luoda konkreettinen tuotos. Opinnäytetyön kehitysosassa luotiin VR-visualisointimallin prototyyppi mikroskooppidatasta. VR-visualisointimallin prototyyppi koostui varsinaisesta mikroskooppikuvan VR-mallista sekä sen käyttöliittymäluonnoksesta. Tutkimusosassa FIMM:n tutkijoiden kokemuksia VR-visualisointimallin prototyypistä tutkittiin teemahaastattelulla. Teemahaastatteluun osallistui seitsemän (n=7) kokenutta tutkijaa. Haastattelut analysoitiin teemoittain ja niiden kuvailevat tunnusluvut on kirjattu.
VR-visualisointimallin prototyyppi luotiin eri kuvankäsittelyohjelmia käyttäen ja valmis työ esiteltiin FIMM:n tutkijoille. Haastatteluista kävi ilmi, että tutkijat kokivat VR-visualisointimallin prototyypin hyväksi tavaksi visualisoida Covid-19-vasta-ainetutkimuksen mikroskooppidataa. Tutkijat kokivat prototyypin hyödylliseksi tutkimusaineiston tarkastelussa ja uskoivat, että tulevaisuudessa tämänkaltaisesta visualisointitavasta olisi hyötyä myös muunlaisen tutkimusaineiston tarkastelussa.
Opinnäytetyön tuloksia voidaan hyödyntää jatkossa molekyylilääketieteeseen suunnatun VR-visualisointiohjelman suunnittelussa. Jatkokehitysehdotuksena mallista voisi luoda interaktiivisen, jolloin mikroskooppikuvasta voisi valita haluamiaan tietoja näkyville. Haastateltavat toivat esille useita hyviä jatkokehitysehdotuksia helpottamaan mikroskooppikuvan tarkastelua. Jatkotutkimusehdotuksena nousi esille 3D-mallin visualisointi VR-ympäristössä.
Opinnäytetyön tutkimusmenetelmäksi valittiin konstruktiivinen tutkimusote, koska tarkoituksena oli luoda konkreettinen tuotos. Opinnäytetyön kehitysosassa luotiin VR-visualisointimallin prototyyppi mikroskooppidatasta. VR-visualisointimallin prototyyppi koostui varsinaisesta mikroskooppikuvan VR-mallista sekä sen käyttöliittymäluonnoksesta. Tutkimusosassa FIMM:n tutkijoiden kokemuksia VR-visualisointimallin prototyypistä tutkittiin teemahaastattelulla. Teemahaastatteluun osallistui seitsemän (n=7) kokenutta tutkijaa. Haastattelut analysoitiin teemoittain ja niiden kuvailevat tunnusluvut on kirjattu.
VR-visualisointimallin prototyyppi luotiin eri kuvankäsittelyohjelmia käyttäen ja valmis työ esiteltiin FIMM:n tutkijoille. Haastatteluista kävi ilmi, että tutkijat kokivat VR-visualisointimallin prototyypin hyväksi tavaksi visualisoida Covid-19-vasta-ainetutkimuksen mikroskooppidataa. Tutkijat kokivat prototyypin hyödylliseksi tutkimusaineiston tarkastelussa ja uskoivat, että tulevaisuudessa tämänkaltaisesta visualisointitavasta olisi hyötyä myös muunlaisen tutkimusaineiston tarkastelussa.
Opinnäytetyön tuloksia voidaan hyödyntää jatkossa molekyylilääketieteeseen suunnatun VR-visualisointiohjelman suunnittelussa. Jatkokehitysehdotuksena mallista voisi luoda interaktiivisen, jolloin mikroskooppikuvasta voisi valita haluamiaan tietoja näkyville. Haastateltavat toivat esille useita hyviä jatkokehitysehdotuksia helpottamaan mikroskooppikuvan tarkastelua. Jatkotutkimusehdotuksena nousi esille 3D-mallin visualisointi VR-ympäristössä.