Genetic variation influencing body size in purebred dogs
Bouirmane, Julia (2016)
Bouirmane, Julia
Turun ammattikorkeakoulu
2016
All rights reserved
Julkaisun pysyvä osoite on
https://urn.fi/URN:NBN:fi:amk-2016053111046
https://urn.fi/URN:NBN:fi:amk-2016053111046
Tiivistelmä
Koiran koon variaatio on suurempi kuin minkään muun nisäkkään. Intensiivisen rotujalostuksen myötä vain pieni määrä geenejä kontrolloi näkyviäkin koiran ominaisuuksia, kuten kokoa. Tässä opinnäytetyössä tutkitaan onko koiran koon ennustaminen mahdollista aiemmin määriteltyjen kokoon liitettyjen geneettisten markkereiden avulla. Koiran geneettisen koon ennustamisella voi olla useita hyviä vaikutuksia, kuten yksilöllisen ruokavalion ja liikunnan suunnittelu. Lisäksi koiran koon ennustaminen voi auttaa oikean yksilön valinnassa kokoon liitettyjen ominaisuuksien perusteella.
Tässä tutkimuksessa käytetty ainutlaatuisen laaja tietokanta kattaa 16 372 koiraeläintä, mukaan lukien 77 sutta, 13 dingoa ja 27 kojoottia, tarjoten kaikkien aikojen suurimman materiaalin koiran pituuteen ja painoon vaikuttavien geenien tutkimuksiin.
Ennalta määritettyjen, kuuden koiran painoon liitetyn yhden emäksen monimuotoisuuden vaikutuksia koiran painoon ja pituuteen määriteltiin tilastollisten menetelmien avulla, sekä tutkittiin tappijalkaisuuden markkereiden vaikutusta koiran korkeuteen.
Kaikilla tutkituilla geneettisillä markkereilla, todettiin olevan vahva koiran kokoa pienentävä vaikutus, kuten jo aiemmissa tutkimuksissa on huomattu. Alleeliyhdistelmien todettiin ennustavan hyvin yksilöiden kokoa, toisaalta alleelien yleisyyksien todettiin ennustavan hyvin rodun kokoluokkaa. Rodun fiksoituneiden alleelien todettiin alleeliyhdistelmiä paremmin ennustavan rodun kokoa mutta vain muutaman rodun todettiin olevan fiksoitunut spesifiselle alleeliyhdistelmälle ja useimminkin alleeliyhdistelmät olivat fiksoituneet jollekin kokoluokalle. Alkukantaisista alleeleista koostuva alleeliryhmä ennustaa koiran samakokoiseksi suden kanssa. Enemmän johdettuja alleeleja sisältävillä harvinaisilla alleeliyhdistelmillä voidaan ennustaa tarkimmin koiran kokoa, jopa vain kuudella markkerilla. Lisäksi uusia, geneettisesti tappijalkaisia rotuja löydettiin ja lyhytjalkaisuuden vaikutusta kokoon tutkittiin.
Loppupäätelmänä voidaan todeta, että tutkittujen geneettisten markkereiden avulla on mahdollista karkeasti ennustaa koiran koko, mutta tarkkaan ennustukseen tarvitaan vielä muitakin geneettisiä markkereita.
Tässä tutkimuksessa käytetty ainutlaatuisen laaja tietokanta kattaa 16 372 koiraeläintä, mukaan lukien 77 sutta, 13 dingoa ja 27 kojoottia, tarjoten kaikkien aikojen suurimman materiaalin koiran pituuteen ja painoon vaikuttavien geenien tutkimuksiin.
Ennalta määritettyjen, kuuden koiran painoon liitetyn yhden emäksen monimuotoisuuden vaikutuksia koiran painoon ja pituuteen määriteltiin tilastollisten menetelmien avulla, sekä tutkittiin tappijalkaisuuden markkereiden vaikutusta koiran korkeuteen.
Kaikilla tutkituilla geneettisillä markkereilla, todettiin olevan vahva koiran kokoa pienentävä vaikutus, kuten jo aiemmissa tutkimuksissa on huomattu. Alleeliyhdistelmien todettiin ennustavan hyvin yksilöiden kokoa, toisaalta alleelien yleisyyksien todettiin ennustavan hyvin rodun kokoluokkaa. Rodun fiksoituneiden alleelien todettiin alleeliyhdistelmiä paremmin ennustavan rodun kokoa mutta vain muutaman rodun todettiin olevan fiksoitunut spesifiselle alleeliyhdistelmälle ja useimminkin alleeliyhdistelmät olivat fiksoituneet jollekin kokoluokalle. Alkukantaisista alleeleista koostuva alleeliryhmä ennustaa koiran samakokoiseksi suden kanssa. Enemmän johdettuja alleeleja sisältävillä harvinaisilla alleeliyhdistelmillä voidaan ennustaa tarkimmin koiran kokoa, jopa vain kuudella markkerilla. Lisäksi uusia, geneettisesti tappijalkaisia rotuja löydettiin ja lyhytjalkaisuuden vaikutusta kokoon tutkittiin.
Loppupäätelmänä voidaan todeta, että tutkittujen geneettisten markkereiden avulla on mahdollista karkeasti ennustaa koiran koko, mutta tarkkaan ennustukseen tarvitaan vielä muitakin geneettisiä markkereita.