Perinnöllistä Late-Onset Spinal Motor Neuronopathy –motoneuronitautia aiheuttavan CHCHD10-geenin sekvensointi
Viljakainen, Veera (2015)
Viljakainen, Veera
Tampereen ammattikorkeakoulu
2015
All rights reserved
Julkaisun pysyvä osoite on
https://urn.fi/URN:NBN:fi:amk-2015112317153
https://urn.fi/URN:NBN:fi:amk-2015112317153
Tiivistelmä
Itä-Suomesta on löytynyt vallitsevasti periytyvä spinaalinen lihasatrofia (spinal muscular atrophy), SMA-sairaus, jonka ensioireet alkavat vasta vanhemmalla iällä. Taudin löysi suomalainen tutkimusryhmä vuonna 2011 ja se sai nimeksi LOSMoN (Late-Onset Lower Motor Neuronopathy), taudista käytetään myös nimeä SMAJ (spinal muscular atrophy Jokela type). Opinnäytetyön aiheena oli Perinnöllistä Late-Onset Spinal Motor Neuronopathy –motoneuronitautia aiheuttavan CHCHD10-geenin sekvensointi. Aihe saatiin Tampereen yliopistolta, Lihastautien tutkimuskeskukselta. Opinnäytetyön tavoitteena oli tuottaa analysoitavaa materiaalia geneetikolle, jotta tämä voi määrittää onko potilaalla SMAJ/LOSMoN vai jokin muu sairaus. Kun tauti ja taudin syntymekanismi on tunnettu, on mahdollisuus kehittää tauteihin uusia hoitomuotoja, kuten esimerkiksi sairastuneiden geeniterapioita. Opinnäytetyön tarkoituksena oli sekvensoida 75:n SMAJ/LOSMoN-tyyppistä tautimuotoa sairastavan potilaan DNA-näytteet ja kuvata geenin sekvensointiin käytetyt menetelmät sekä koota tietoa motoneuronitaudeista, erityisesti SMAJ/LOSMoN-taudista. Opinnäytetyön tehtävänä oli selvittää, esiintyykö aineistossa muita CHCHD10-geenin mutaatioita jo löydetyn G66V-mutaation lisäksi.
Aineistosta ei löytynyt uusia mutaatioita todennäköisesti siksi, että kaikki tunnetut CHCHD10-geenin mutaatiot sijaitsevat eksonissa 2. Tässä aineistossa oli tutkittavana geenin eksonit 1 ja 3-4. Tutkimustulos tukee oletusta, että eksoneissa 1 ja 3-4 ei ole tautia aiheuttavia mutaatioita. Toistaiseksi löydetyt sairauksia aiheuttavat tunnetut mutaati-ot sijaitsevat lähekkäin CHCHD10-geenissä, mutta aiheuttavat hyvin erilaisia tauteja. Mutaatiot G66V, G58R ja S59L sijaitsevat hyvin lähekkäin proteiinin rakenteessa ja hydrofobisen heliksin alueella. Kuitenkin tautien vakavuusasteissa on huomattava ero, G66V-mutaatio aiheuttaa oirekuvaltaan huomattavasti lievempää tautia kuin S59L-mutaatio, joka aiheuttaa vakavan ALS-taudin. G66V-mutaatio CHCHD10-geenissä ei aiheuta muita sairauksia kuin SMAJ/LOSMoN-taudin. Yllättävää on, että G66V-mutaatio ei aiheuta mitokondriovauriota, vaikka CHCHD10-geeni on ensimmäinen identifioitu SMA-tautia aiheuttava geeni, joka koodaa mitokondriaalista proteiinia.
Jatkotutkimusaiheena esitetään CHCHD10-proteiinin tertiäärirakenteen ja proteiinin toiminnan tutkimista, jotta saataisiin selville SMAJ/LOSMoN-taudin sekä muiden CHCHD10-geenin mutaatioiden aiheuttamien tautien patogeeninen mekanismi.
Aineistosta ei löytynyt uusia mutaatioita todennäköisesti siksi, että kaikki tunnetut CHCHD10-geenin mutaatiot sijaitsevat eksonissa 2. Tässä aineistossa oli tutkittavana geenin eksonit 1 ja 3-4. Tutkimustulos tukee oletusta, että eksoneissa 1 ja 3-4 ei ole tautia aiheuttavia mutaatioita. Toistaiseksi löydetyt sairauksia aiheuttavat tunnetut mutaati-ot sijaitsevat lähekkäin CHCHD10-geenissä, mutta aiheuttavat hyvin erilaisia tauteja. Mutaatiot G66V, G58R ja S59L sijaitsevat hyvin lähekkäin proteiinin rakenteessa ja hydrofobisen heliksin alueella. Kuitenkin tautien vakavuusasteissa on huomattava ero, G66V-mutaatio aiheuttaa oirekuvaltaan huomattavasti lievempää tautia kuin S59L-mutaatio, joka aiheuttaa vakavan ALS-taudin. G66V-mutaatio CHCHD10-geenissä ei aiheuta muita sairauksia kuin SMAJ/LOSMoN-taudin. Yllättävää on, että G66V-mutaatio ei aiheuta mitokondriovauriota, vaikka CHCHD10-geeni on ensimmäinen identifioitu SMA-tautia aiheuttava geeni, joka koodaa mitokondriaalista proteiinia.
Jatkotutkimusaiheena esitetään CHCHD10-proteiinin tertiäärirakenteen ja proteiinin toiminnan tutkimista, jotta saataisiin selville SMAJ/LOSMoN-taudin sekä muiden CHCHD10-geenin mutaatioiden aiheuttamien tautien patogeeninen mekanismi.