Entsyymianalytiikan automatisointi
Saarinen, Pauliina (2014)
Saarinen, Pauliina
Metropolia Ammattikorkeakoulu
2014
All rights reserved
Julkaisun pysyvä osoite on
https://urn.fi/URN:NBN:fi:amk-2014052610064
https://urn.fi/URN:NBN:fi:amk-2014052610064
Tiivistelmä
Työn tarkoituksena oli ottaa käyttöön ksylanaasiaktiivisuuden määritysmenetelmä Tecan Freedom EVO -nesteenkäsittelyrobotilla ja säätää laite vastaamaan käsintehtäviä analyysejä. Lisäksi testattiin pyökin ksylaanin soveltuvuutta substraatiksi koivun ksylaanin tilalle, sillä koivun ksylaanin valmistus on lopetettu. Työssä määritettiin ksylanaasiaktiivisuudet BXU-ksylanaasimenetelmällä yhdeksällä eri mikrobikannalla tuotetuista entsyymipuolivalmisteista. Määritykset tehtiin rinnakkain sekä laitteella että manuaalisesti ja molemmilla substraateilla. Tuloksia käsiteltiin R-ohjelmalla ja Excelillä.
Analyysin siirtäminen robotille pienensi oletetusti tulosten hajontaa ja poisti virhelähteitä. Analyysin tekeminen myös nopeutui, sillä yhdellä kertaa voi analysoida suuren määrän näytteitä verrattuna manuaalimenetelmään. Nesteenkäsittelyrobotin käyttöönoton myötä myös reagenssien kulutus pieneni ja pipetoinnin erityisesti laborantin kättä kuormittavat toistoliikkeet poistuivat. Analyysi voitiin siirtää robotille, sillä tulokset verrattuna manuaalimenetelmään olivat riittävän samanlaisia.
Pyökin ksylaanin todettiin soveltuvan käytettäväksi koivun ksylaanin tilalla, joskin hajonta näytti olevan hieman suurempaa. Pyökin ksylaani erosi sekä väriltään että sameudeltaan koivun ksylaanista. Pyökkisubstraattia käytettäessä näytteiden ja näytenollien absorbanssit olivat suurempia kuin koivusubstraattia käytettäessä. Tilastolliset testit osoittivat tilastollisesti merkitsevän eron koivun ja pyökin ksylaanin välillä, mutta käytännössä ero ei ollut merkitsevä, sillä tuloksissa sallitaan tietty vaihtelu.
Nesteenkäsittelyrobottia on tulevaisuudessa tarkoitus käyttää muussakin entsyymianalytiikassa.
Analyysin siirtäminen robotille pienensi oletetusti tulosten hajontaa ja poisti virhelähteitä. Analyysin tekeminen myös nopeutui, sillä yhdellä kertaa voi analysoida suuren määrän näytteitä verrattuna manuaalimenetelmään. Nesteenkäsittelyrobotin käyttöönoton myötä myös reagenssien kulutus pieneni ja pipetoinnin erityisesti laborantin kättä kuormittavat toistoliikkeet poistuivat. Analyysi voitiin siirtää robotille, sillä tulokset verrattuna manuaalimenetelmään olivat riittävän samanlaisia.
Pyökin ksylaanin todettiin soveltuvan käytettäväksi koivun ksylaanin tilalla, joskin hajonta näytti olevan hieman suurempaa. Pyökin ksylaani erosi sekä väriltään että sameudeltaan koivun ksylaanista. Pyökkisubstraattia käytettäessä näytteiden ja näytenollien absorbanssit olivat suurempia kuin koivusubstraattia käytettäessä. Tilastolliset testit osoittivat tilastollisesti merkitsevän eron koivun ja pyökin ksylaanin välillä, mutta käytännössä ero ei ollut merkitsevä, sillä tuloksissa sallitaan tietty vaihtelu.
Nesteenkäsittelyrobottia on tulevaisuudessa tarkoitus käyttää muussakin entsyymianalytiikassa.