EGFR-mutaatiokitin verifiointi
Toivanen, Anne (2012)
Toivanen, Anne
Turun ammattikorkeakoulu
2012
All rights reserved
Julkaisun pysyvä osoite on
https://urn.fi/URN:NBN:fi:amk-2012112917333
https://urn.fi/URN:NBN:fi:amk-2012112917333
Tiivistelmä
Epidermaalinen kasvutekijäreseptori (EGFR) välittää solunulkoisia viestejä solun sisäosiin, osallistuen solujen kasvun ja lisääntymisen säätelyyn. Se esiintyy useissa solutyypeissä. Ei-pienisoluisessa
keuhkosyövässä on havaittu useita EGFR-geenin virheitä, jotka kohdistuvat reseptorin tyrosiinikinaasidomeeniin. Geenivirheiden vaikutuksesta EGFR yliaktivoituu johtaen kasvusignaalien moninkertaistumiseen ja lopulta solun muuntumiseen syöpäsoluksi.
Geenitekninen kehitys on mahdollistanut syöpäkudokseen kohdistuvien täsmälääkkeiden valmistamisen. Mutaatiotestauksella voidaan määrittää keuhkosyöpäkudoksessa mahdollisesti
esiintyvät EGFR:n geenivirheet. Tuloksen perusteella potilaalle voidaan määrätä täsmälääkityksenä ns. tyrosiinikinaasiestäjiä, jotka vaikuttavat elimistössä suoraan solujen virheellisen EGFR:n toimintaan ja hillitsevät sitä kautta pahanlaatuista kasvua.
Tämän opinnäytetyön tarkoituksena oli testata AmoyDx:n EGFR-mutaatiokitin soveltuvuutta käytössä olevan ja markkinoilta poistuvan kitin tilalle. Kitin testaus suoritettiin ajamalla mutaatiostatukseltaan tunnettuja näytteitä reaaliaikaisella kvantitatiivisella PCR:llä (qPCR).
qPCR-ajojen tulokset analysoitiin ja niitä verrattiin aikaisempiin tuloksiin.
Työn keskeiset tulokset osoittivat, että AmoyDx:n kitti soveltuu EGFR-mutaatiotutkimuksiin. Yhteensä analysoitiin 24 potilasnäytettä (N=24), joista 23:sta saatiin aiempaa vastaava tulos. Yhden näytteen tulos jäi hieman uuden kitin ohjeistettujen raja-arvojen ulkopuolelle.
Standardireaktioiden tulosten perusteella voitiin päätellä, että kaikki kitin mutaatioreagenssit toimivat hyvin. Kaiken kaikkiaan opinnäytetyön tavoitteet saavutettiin ja menetelmästä kirjoitettiin työohje.
keuhkosyövässä on havaittu useita EGFR-geenin virheitä, jotka kohdistuvat reseptorin tyrosiinikinaasidomeeniin. Geenivirheiden vaikutuksesta EGFR yliaktivoituu johtaen kasvusignaalien moninkertaistumiseen ja lopulta solun muuntumiseen syöpäsoluksi.
Geenitekninen kehitys on mahdollistanut syöpäkudokseen kohdistuvien täsmälääkkeiden valmistamisen. Mutaatiotestauksella voidaan määrittää keuhkosyöpäkudoksessa mahdollisesti
esiintyvät EGFR:n geenivirheet. Tuloksen perusteella potilaalle voidaan määrätä täsmälääkityksenä ns. tyrosiinikinaasiestäjiä, jotka vaikuttavat elimistössä suoraan solujen virheellisen EGFR:n toimintaan ja hillitsevät sitä kautta pahanlaatuista kasvua.
Tämän opinnäytetyön tarkoituksena oli testata AmoyDx:n EGFR-mutaatiokitin soveltuvuutta käytössä olevan ja markkinoilta poistuvan kitin tilalle. Kitin testaus suoritettiin ajamalla mutaatiostatukseltaan tunnettuja näytteitä reaaliaikaisella kvantitatiivisella PCR:llä (qPCR).
qPCR-ajojen tulokset analysoitiin ja niitä verrattiin aikaisempiin tuloksiin.
Työn keskeiset tulokset osoittivat, että AmoyDx:n kitti soveltuu EGFR-mutaatiotutkimuksiin. Yhteensä analysoitiin 24 potilasnäytettä (N=24), joista 23:sta saatiin aiempaa vastaava tulos. Yhden näytteen tulos jäi hieman uuden kitin ohjeistettujen raja-arvojen ulkopuolelle.
Standardireaktioiden tulosten perusteella voitiin päätellä, että kaikki kitin mutaatioreagenssit toimivat hyvin. Kaiken kaikkiaan opinnäytetyön tavoitteet saavutettiin ja menetelmästä kirjoitettiin työohje.