Koagulaasipositiivisten stafylokokkien pitoisuusmääritysmenetelmän validointi
Kolehmainen, Tiina (2012)
Kolehmainen, Tiina
Metropolia Ammattikorkeakoulu
2012
All rights reserved
Julkaisun pysyvä osoite on
https://urn.fi/URN:NBN:fi:amk-2012091113574
https://urn.fi/URN:NBN:fi:amk-2012091113574
Tiivistelmä
Opinnäytetyön tavoitteena oli ottaa Valio Oy:n käyttöön vaihtoehtoinen menetelmä, jonka avulla saataisiin tehtyä koagulaasipositiivisten stafylokokkien pitoisuusmääritykset nopeammin ja vähemmällä työajalla verrattaessa käytössä olevaan ISO 6888-1: 1999 -referenssimenetelmään. Samalla arvioitiin saataisiinko alustaa vaihtamalla aikaiseksi säästöjä. Validoinnin suureina olivat menetelmien suhteellinen oikeellisuus, lineaarisuus, täsmällisyys sekä spesifisyys.
Vaihtoehtoisiksi menetelmiksi valittiin Brilliance Staph 24 - sekä ISO 6888-2: 1999 (RPF) -määritysmenetelmät, joita verrattiin käytössä olevaan referenssimenetelmään. Menetelmien tulosten oikeellisuutta tutkittiin meijeriteollisuuden tuotenäytteillä, jotka keinotekoisesti kontaminoitiin Staphylococcus aureus -kannalla kolmella eri pitoisuudella. Lisäksi lineaarisuutta tutkittiin yhdellä matriisilla, viidellä eri pitoisuudella. Menetelmien täsmällisyys ja spesifisyys määritettiin käyttämällä referenssimateriaalia, jonka S. aureus -pitoisuus oli valmistajan toimesta varmennettu 95 %:n luottamustasolla. Menetelmien spesifisyyttä tutkittiin myös siirrostamalla alustoille S. aureus -bakteerin lähisukuisia mikrobikantoja sekä tutkimalla normaalinäytteitä.
Vertailtavien menetelmien keskiarvojen välillä ei havaittu merkittäviä eroja 95 %:n luottamustasolla. Menetelmien korrelaatio referenssimenetelmään oli molemmilla vertailtavilla menetelmillä korkea (r > 0,99). Menetelmien täsmällisyys ja uusittavuus olivat hyväksyttävällä tasolla. Spesifisyyttä tutkittaessa voitiin todeta, että käytössä olevalla Baird-Parker -alustalla kasvoi suuressa osassa näytteitä muuta häiritsevää kasvua kohde-organismin lisäksi. Varmistustestit lisäsivät menetelmän käyttökustannuksia huomattavasti.
Vertailun perusteella Brilliance Staph 24 valittiin käyttöön. Brilliance Staph 24 -alustan voitiin todeta antavan yhtenevät pitoisuustulokset, verrattuna ISO 6888-1: 1999 -menetelmään, mutta se oli erittäin paljon spesifisempi, jolloin varmistustestien määrä oli pienempi.
Brilliance Staph 24 -alusta on tällä hetkellä FINAS-akkreditoitu ja käytössä Valiolla Mikrobiologinen laatu -laboratoriossa ja Lapinlahden aluelaboratoriossa.
Vaihtoehtoisiksi menetelmiksi valittiin Brilliance Staph 24 - sekä ISO 6888-2: 1999 (RPF) -määritysmenetelmät, joita verrattiin käytössä olevaan referenssimenetelmään. Menetelmien tulosten oikeellisuutta tutkittiin meijeriteollisuuden tuotenäytteillä, jotka keinotekoisesti kontaminoitiin Staphylococcus aureus -kannalla kolmella eri pitoisuudella. Lisäksi lineaarisuutta tutkittiin yhdellä matriisilla, viidellä eri pitoisuudella. Menetelmien täsmällisyys ja spesifisyys määritettiin käyttämällä referenssimateriaalia, jonka S. aureus -pitoisuus oli valmistajan toimesta varmennettu 95 %:n luottamustasolla. Menetelmien spesifisyyttä tutkittiin myös siirrostamalla alustoille S. aureus -bakteerin lähisukuisia mikrobikantoja sekä tutkimalla normaalinäytteitä.
Vertailtavien menetelmien keskiarvojen välillä ei havaittu merkittäviä eroja 95 %:n luottamustasolla. Menetelmien korrelaatio referenssimenetelmään oli molemmilla vertailtavilla menetelmillä korkea (r > 0,99). Menetelmien täsmällisyys ja uusittavuus olivat hyväksyttävällä tasolla. Spesifisyyttä tutkittaessa voitiin todeta, että käytössä olevalla Baird-Parker -alustalla kasvoi suuressa osassa näytteitä muuta häiritsevää kasvua kohde-organismin lisäksi. Varmistustestit lisäsivät menetelmän käyttökustannuksia huomattavasti.
Vertailun perusteella Brilliance Staph 24 valittiin käyttöön. Brilliance Staph 24 -alustan voitiin todeta antavan yhtenevät pitoisuustulokset, verrattuna ISO 6888-1: 1999 -menetelmään, mutta se oli erittäin paljon spesifisempi, jolloin varmistustestien määrä oli pienempi.
Brilliance Staph 24 -alusta on tällä hetkellä FINAS-akkreditoitu ja käytössä Valiolla Mikrobiologinen laatu -laboratoriossa ja Lapinlahden aluelaboratoriossa.