miRNA:t keuhkosyövässä : miRNA:n ekspression varmistus reaaliaikaisella RT-qPCR:llä
Leskinen, Heini; Maunula, Johanna (2012)
Leskinen, Heini
Maunula, Johanna
Metropolia Ammattikorkeakoulu
2012
All rights reserved
Julkaisun pysyvä osoite on
https://urn.fi/URN:NBN:fi:amk-201205249656
https://urn.fi/URN:NBN:fi:amk-201205249656
Tiivistelmä
Keuhkosyöpä on maailman yleisin syöpä ja Suomessakin se on yksi yleisimmistä. Keuhkosyövät jaetaan kahteen ryhmään: pienisoluiseen ja ei-pienisoluiseen keuhkosyöpään. Noin 85 % kaikista keuhkosyövistä on ei-pienisoluista tyyppiä. Keuhkosyövän ennuste on usein huono huolimatta diagnoosin ja hoidon laajasta kehityksestä. Syöpätautien hoidossa suurena ongelmana on hoitoresistenssi ja siten uusia hoitomuotoja pyritään kehittämään jatkuvasti. Uusien tutkimusten taustalla on pyrkimys muun muassa verestä ja kudoksesta löydettävien biomarkkerien käyttöön syövän ennaltaehkäisyssä, diagnosoinnissa ja ennusteen arvioinnissa.
Uudet tutkimukset ovat osoittaneet miRNA:n vaikutuksen karsinogeneesiin ja luoneet uusia odotuksia hoidon parantamiseen ja keuhkosyövän ennusteeseen. miRNA:t ovat pieniä RNA-molekyylejä, jotka säätelevät geeniekspressiota ja ovat siten tärkeä osa monia biologisia prosesseja. miRNA:t säätelevät ainakin 30 % kaikista ihmisen proteiinia koodaavista geeneistä.
miRNA:n ekspression on todettu poikkeavan syöpäkudoksessa; miRNA:t voivat olla joko yli- tai aliekspressoituneita.
Helsingin yliopiston Haartman-instituutin sytomolekyyligenetiikan laboratorion tutkimusryhmä tutkii miRNA:n yhteyttä ei-pienisoluiseen keuhkosyöpään. He olivat tutkineet miRNA:n eks-pressiota keuhkosyöpänäytteistä mikrosirumenetelmällä. Tavoitteenamme oli analysoida mikrosirumenetelmällä jo analysoituja näytteitä reaaliaikaisella RT-qPCR:llä ja vertailla saatuja tuloksia. Työmme tarkoituksena oli selvittää, miten tulokset vastasivat toisiaan.
Tutkimme kahden miRNA:n (miR-3907 ja miR-494) ekspressiota 20 keuhkosyöpänäytteestä. Reaaliaikaisen RT-qPCR:n tulokset miR-3907:n ekspression osoittamisessa vastasivat mikrosirumenetelmällä saatuja tuloksia 85 %:sti. Toisaalta miR-494-aluke edellyttää lisäoptimointia, eivätkä saadut tulokset ole vertailukelpoisia. Siten yhteneväisyys reaaliaikaisen RT-qPCR:n ja mikrosirumenetelmän välillä oli suuri miR-3907-aluketta käytettäessä.
Uudet tutkimukset ovat osoittaneet miRNA:n vaikutuksen karsinogeneesiin ja luoneet uusia odotuksia hoidon parantamiseen ja keuhkosyövän ennusteeseen. miRNA:t ovat pieniä RNA-molekyylejä, jotka säätelevät geeniekspressiota ja ovat siten tärkeä osa monia biologisia prosesseja. miRNA:t säätelevät ainakin 30 % kaikista ihmisen proteiinia koodaavista geeneistä.
miRNA:n ekspression on todettu poikkeavan syöpäkudoksessa; miRNA:t voivat olla joko yli- tai aliekspressoituneita.
Helsingin yliopiston Haartman-instituutin sytomolekyyligenetiikan laboratorion tutkimusryhmä tutkii miRNA:n yhteyttä ei-pienisoluiseen keuhkosyöpään. He olivat tutkineet miRNA:n eks-pressiota keuhkosyöpänäytteistä mikrosirumenetelmällä. Tavoitteenamme oli analysoida mikrosirumenetelmällä jo analysoituja näytteitä reaaliaikaisella RT-qPCR:llä ja vertailla saatuja tuloksia. Työmme tarkoituksena oli selvittää, miten tulokset vastasivat toisiaan.
Tutkimme kahden miRNA:n (miR-3907 ja miR-494) ekspressiota 20 keuhkosyöpänäytteestä. Reaaliaikaisen RT-qPCR:n tulokset miR-3907:n ekspression osoittamisessa vastasivat mikrosirumenetelmällä saatuja tuloksia 85 %:sti. Toisaalta miR-494-aluke edellyttää lisäoptimointia, eivätkä saadut tulokset ole vertailukelpoisia. Siten yhteneväisyys reaaliaikaisen RT-qPCR:n ja mikrosirumenetelmän välillä oli suuri miR-3907-aluketta käytettäessä.