EML4-ALK-fuusio-onkogeenin osoittaminen parafiinileikkeestä FISH-menetelmän avulla adenokarsinooman diagnostiikassa : tulosten vertaaminen immunohistokemian avulla saatuihin tuloksiin
Hokkanen, Emmi; Tikkanen, Milja (2011)
Hokkanen, Emmi
Tikkanen, Milja
Metropolia Ammattikorkeakoulu
2011
All rights reserved
Julkaisun pysyvä osoite on
https://urn.fi/URN:NBN:fi:amk-2011120216996
https://urn.fi/URN:NBN:fi:amk-2011120216996
Tiivistelmä
Keuhkosyöpä on maailman yleisin syöpä niin ilmaantuvuuden kuin kuolleisuuden suhteen ja sen suurin riskitekijä on tupakointi. Keuhkosyöpä jaetaan kahteen pääryhmään, pienisoluiseen karsinoomaan ja ei-pienisoluiseen karsinoomaan. Adenokarsinooma on yksi ei-pienisoluisen karsinooman alatyyppi, johon potilaan tupakointihistorian on todettu vaikuttavan vähiten. Mutaatio EML4:n (echinoderm microtubule-associated protein-like 4) ja ALK:n (anaplastic lymphoma kinase) välillä on huomattu olevan yksi adenokarsinoomaa aiheuttava tekijä, jonka aktivaatio aiheuttaa syöpäsolukon synnyn. Tämä aktivaatio voidaan pysäyttää pienimolekyylisellä inhibiittorilla, crizotinibilla.
Suoritimme opinnäytetyömme Haartman Instituutin sytomolekyyligenetiikan tutkijaryhmässä Helsingissä syksyllä 2011. Työn tarkoituksena oli osoittaa EML4-ALK-fuusio-onkogeeni adenokarsinoomapotilaiden kudosnäytteistä fluoresenssi in situ hybridisaatio-menetelmän avulla (FISH) ja lopuksi vertailla saamiamme tuloksia immunohistokemian (IHC) avulla saatuihin tuloksiin, jotka saimme HUSLABin keskuspatologian laboratoriosta. Tavoitteena oli myös selvittää FISH-menetelmän toimivuutta EML4-ALK-fuusio-onkogeenin osoittamisessa uudella Vysis ALK Break Apart FISH Probe -reagenssipakkauksella tehtynä.
Tutkimme FISH-menetelmän avulla 31 näytettä, joista yksi oli EML4-ALK-positiivinen ja 30 oli EML4-ALK-negatiivisia. Löytämämme positiivinen näyte tulkittiin immunohistokemian menetelmän avulla negatiiviseksi. Tämän tuloksen vertaamisen jälkeen EML4-ALK-fuusio-onkogeenin osoittaminen IHC:lla päätettiin lopettaa, sillä se ei ollut riittävän spesifinen tutkimusmenetelmä.
Saatujen tuloksien myötä voimme todeta, että IHC-menetelmää tulisi kehittää ja testata lisää, jotta sitä voitaisiin käyttää luotettavasti EML4-ALK-fuusio-onkogeenin osoittamiseen. Meidän kokemuksiemme mukaan uutta FISH-reagenssipakkausta voidaan käyttää luotettavasti EML4-ALK-fuusio-onkogeenin osoittamiseen, sillä kaikki valmistamamme FISH-valmisteet onnistuivat ja olivat analysoitavissa.
Suoritimme opinnäytetyömme Haartman Instituutin sytomolekyyligenetiikan tutkijaryhmässä Helsingissä syksyllä 2011. Työn tarkoituksena oli osoittaa EML4-ALK-fuusio-onkogeeni adenokarsinoomapotilaiden kudosnäytteistä fluoresenssi in situ hybridisaatio-menetelmän avulla (FISH) ja lopuksi vertailla saamiamme tuloksia immunohistokemian (IHC) avulla saatuihin tuloksiin, jotka saimme HUSLABin keskuspatologian laboratoriosta. Tavoitteena oli myös selvittää FISH-menetelmän toimivuutta EML4-ALK-fuusio-onkogeenin osoittamisessa uudella Vysis ALK Break Apart FISH Probe -reagenssipakkauksella tehtynä.
Tutkimme FISH-menetelmän avulla 31 näytettä, joista yksi oli EML4-ALK-positiivinen ja 30 oli EML4-ALK-negatiivisia. Löytämämme positiivinen näyte tulkittiin immunohistokemian menetelmän avulla negatiiviseksi. Tämän tuloksen vertaamisen jälkeen EML4-ALK-fuusio-onkogeenin osoittaminen IHC:lla päätettiin lopettaa, sillä se ei ollut riittävän spesifinen tutkimusmenetelmä.
Saatujen tuloksien myötä voimme todeta, että IHC-menetelmää tulisi kehittää ja testata lisää, jotta sitä voitaisiin käyttää luotettavasti EML4-ALK-fuusio-onkogeenin osoittamiseen. Meidän kokemuksiemme mukaan uutta FISH-reagenssipakkausta voidaan käyttää luotettavasti EML4-ALK-fuusio-onkogeenin osoittamiseen, sillä kaikki valmistamamme FISH-valmisteet onnistuivat ja olivat analysoitavissa.